Presse médicale
Il y a 8 jours
Identification en ligne des agents fongiques par spectrométrie de masse et détection d’espèces émergentes

Publication date: September 2017
Source:Journal de Mycologie Médicale / Journal of Medical Mycology, Volume 27, Issue 3
Author(s): Anne-Cécile Normand, Carole Cassagne, Lilia Hasseine, Martine Gari-Toussaint, Frédéric Gabriel, Isabelle Accoceberry, Damien Costa, Nathalie Bourgeois, Sophie Cassaing, Cécile Nabet, Christine Bonnal, Hélène Raberin, Markus Stein, Ignace Surmont, Denis Pierard, Farid Djenad, Jean-Luc Donnadieu, Martine Piarroux, Stéphane Ranque, Pierre Becker, Marijke Hendrickx, Renaud Piarroux
La diversité des agents fongiques, couplée aux difficultés de leur identification, complique sérieusement la détection des phénomènes émergents. Ces problèmes gênent aussi la constitution de cohortes visant à mieux comprendre l’épidémiologie et le pouvoir pathogène des agents fongiques incriminés. La spectrométrie de masse de type MALDI-TOF, en facilitant l’identification des moisissures et des dermatophytes et en centralisant, via un site d’identification en ligne, les spectres de plusieurs CHU, pourrait aider à surmonter ces difficultés.Une application web, reposant sur des algorithmes originaux couplés à une base de références conséquente (458 espèces, 139 genres fongiques) a été développée avec plusieurs CHU pour mieux identifier par spectrométrie de masse les champignons impliqués en pathologie humaine. L’application renvoie des scores s’échelonnant de 0 à 100, où 100 correspond à une identité parfaite avec le spectre de référence reconnu.Le seuil d’identification a été établi à partir d’un premier panel de 422 souches (126 espèces) préalablement identifiées par séquençage. Les performances de l’application ont ensuite été testées sur panel d’évaluation comprenant 1274 isolats cliniques (108 taxa de moisissures et de dermatophytes). Enfin, nous avons analysé les résultats de 14 249 spectres identifiés prospectivement (score25) entre août et décembre 2016 par 10 laboratoires de mycologie médicale (hôpital Bichat, CHU de Bordeaux, CHU de Cayenne, CHU de Marseille, CHU de Montpellier, CHU de Nice, CHU de Rouen, CHU de Saint-Étienne, CHU de Toulouse et HSC de Winnipeg) afin de tester la capacité du dispositif à détecter des pathogènes émergents.La quasi-totalité des isolats du panel d’évaluation ont été correctement identifiés à l’espèce (95,97 %, 1097 isolats) ou au genre (4,03 %, 43 isolats). L’utilisation d[...]

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Souffrance et travail

La fusion des IRP va entraîner la disparition « autoritaire » du CHSCT comme instance autonome, dénonce l’ADEAIC, association des experts agréés auprès des CHSCT, qui regroupe plutôt les petits cabinets.

La co-présidente d’ADEAIC, Annabelle Chassagnieux, déplore un retour à la situation d’avant les lois Auroux, avec un amoindrissement des prérogatives et des moyens des élus en matière de conditions de travail.

Aux côtés du SEA-CHSCT, un syndicat qui rassemble les poids lourds de la profession (Secafi, Technologia, Syndex,etc.), l’ADEAIC, créée en 2015, représente une vingtaine de cabinets spécialisés auprès des CHSCT, plutôt de taille modeste. Une grande partie des expertises de ces cabinets (environ les deux-tiers) auprès des CHSCT sont réalisées dans le cadre de la mission que les élus peuvent lancer à l’occasion d’un projet modifiant de façon importante les conditions de travail. Le projet d’ordonnance va imposer que cette expertise soit cofinancée à hauteur de 20% par le comité social et économique (CSE).

« En pratique, cela va empêcher les élus d’entreprises de 200 à 300 salariés de pouvoir faire réaliser ces expertises, faute de budget », alerte Annabelle Chassagnieux, du cabinet Apteis, également co-présidente de l’ADEAIC. De plus, ajoute-t-elle, les élus risquent d’être confrontés à des débats au sein de l’instance sur l’opportunité de réaliser une expertise, alors que le reliquat annuel du budget de fonctionnement pourra être utilisé pour financer des activités sociales et culturelles toujours prisées par les salariés.

Le choix des termes de l’ordonnance

La formulation retenue pour les expertises jusqu’à présent diligentées par le CHSCT fait aussi grincer les dents des spécialistes. « Le futur article L. 2315-93 nous parle maintenant d’une expertise « qualité du travail et de l’emploi », comme s’il ne fallait plus parler de l’organisation du travail et de ses conséquences pour la santé et la sécurité des salariés ! » s’exclame Annabelle Chassagnieux. Cette dernière voit derrière ces nouveaux intitulés à l’apparente neutralité une volonté sous-jacente de mettre en avant des notions floues (comme la qualité de vie au travail, par exemple) pour ne surtout pas mettre[...]

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APF ICM

Je m'appelle Thibault, j'ai 28 ans et je vis en fauteuil roulant car je suis infirme moteur cérébral à 80% et atteint d'un handicap orphelin suite à un accident lors de ma naissance. Je vis chez mes parents mais dans la journée, je travaille dans un ESAT sur poste informatique à Strasbourg.

J'ai plusieurs passions : j'aime la vie, je tire à l'arc et je suis cavalier de l'équipe de France de para-dressage. Je suis 10 fois champion de France et vice-champion 2014 de dressage et je monte des chevaux de haut niveau ( ceux de la Garde Républicaine et ceux du Cadre Noir). J'ai été le sujet de deux documentaires qui racontent mon aventure avec les chevaux : "ma plus belle histoire" (2010) et "le défi de Thibault" (2012). Source : http://thibaultstoc.wixsite.com/thibault-stoclin.

Page face book : Stoclin Thibault cavalier de l'équipe de France de para-dressage


2 extraits :

https://www.youtube.com/watch ?v=Ism1m-sk1eo

Le défi de Thibault - Equidia Life


EXTRAIT - Ma plus belle histoire - Equidia Life https://youtu.be/FWFZeUv7oXU


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Après le bac, l'indépendance, la liberté... Et le job étudiant pour payer le loyer. Exploitation assurée? Échec à la fac programmé? Rien de tout ça pour moi. Mieux encore. Vendre des fringues, j'ai adoré!